Evaluation et taxonomie numérique de quelques souches d’actinomycètes filamenteux isolées d’un sol agricole de la région de Guelma

Abstract

Le présent travail est une étude phénotypique de quelques souches d’actinomycètes isolées d’un sol agricole de la région de Guelma. Treize souches d’actinomycètes codées FRO9, FRO15, FRO18, FRO19, C15, BES3, KRO3, KRO7, KRO8, KRO9, KRO11, KRO13 et KRO14, ont fait l’objet d’une étude phénotypique afin de déterminer leurs morphologie et leurs capacité métabolique et aussi d’étudier leurs similitudes par taxonomie numérique. Tous les tests réalisés sont étudiés sur milieux solides additionné aux substrats d’intérêt. La taxonomie numérique est établie par le logiciel Past 3, dont la matrice de similarité est établie parllelcoefficientldelJaccardletllesldendrogrammeslsontlobtenuslparldeuxlalgorithmes (UPGMA et NJ). L’étude morphologiques, montrent que les huit isolats FRO15, FRO18, BES3, KRO3, KRO7, KRO8, KRO11 et KRO13 présentent les traits typique des Streptomycètes. L’étude physiologique et biochimique des souches a permis de déterminer certaines caractéristiques physiologiques et biochimique importantes de ces souches, tels que la croissance à différente pH et surtout dans des pH alcalin, et différentes concentrations en NaCl avec une tolérance jusqu’au 10% pour la plupart des souches. De même, ces isolats ont la capacité à assimiler différentes sources de carbone et d’azote et à dégrader plusieurs polymères complexes tels que la caséine, l’amidon et le tween 80. L’établissement d’une taxonomie numérique sur l’ensemble des souches isolées a permet les classés en quatre groupes phénotypiquement distincts, dont la souche FRO15 forme un groupe séparé sur les deux dendrogrammes, ce qui signifie que phénotypiquement cette souche est loin des autres. Les souches C15 et KRO14 existe toujours dans le même groupe, de même, les souches KRO3, KRO11, KRO8, FRO18, KRO7et KRO13 sont toujours regroupés dans le même groupe avec les deux méthodes appliquées pour la construction du dendrogramme