Résumé:
La taxonomie ou taxinomie est l'étude de la diversité des micro-organismes, est généralement prise comme synonyme de la systématique ou de la bio systématique et des relations susceptibles d'exister entre eux. Elle recouvre trois domaines différents : la classification, la nomenclature et l'identification. La classification est définis comme l'arrangement des organismes en groupe ou taxon selon leur similitude ou leur parente évolutive, L'identification consiste à placer un individu particulier dans un taxon connu, et la nomenclature est l'ensemble des règles qui préside à l'attribution d'un nom à chaque taxon. La taxonomie bactérienne moderne vise l'intégration de toutes les donnés et les informations phénotypiques, génotypiques et phylogénétiques menant à une taxonomie polyphasique et une classification plus stable pour designer des taxa à tous les niveaux