Etude de l’effet de la variabilité génétique de l’espèce Allium cepa L. et Allium sativum L.sur la production et l’accumulation des huiles essentielles et sur leurs effets antibactériens

Abstract

Dans le cadre de la préservation de la biodiversité de l’espèce Allium sativum et Allium cepa en Algérie ; Nous avons réalisés une étude comparative entre quatre variétés de la première espèce et entre trois variétés de la deuxième espèce par la caractérisation morphologique, biochimique ainsi que moléculaire et enfin l’évaluation de leurs pouvoir antibactérien vis-à-vis de quatre souches bactériennes. Les résultats ont dévoilé une importante variabilité phénotypique du patrimoine génétique des cultivars des deux espèces. La caractérisation morphologique basée sur les descripteurs morphologiques a révélé l’importance des descripteurs : épaisseur des écailles sèches, adhérence des écailles après récoltes, épaisseur du collet de bulbe et la couleur des écailles sèches dans la discrimination des variétés d’oignon, comme elle montre l’importance de certaines catégories telles que la position des caïeux à l'extrémité supérieure du bulbe, compacité des caïeux, distribution des caïeux et couleur de la chair pour discriminer les variétés d’ail. L’étude morphologique portant sur les caractères quantitatifs a montré une importante fluctuation du rendement en bulbe, du nombre de bulbe par kilogramme et du poids d’un Bulbe chez les variétés de l’ail et une importante variabilité du rendement en bulbe, du nombre de bulbe par kilogramme, du poids d’un Bulbe, nombre de points végétatifs par kg et le nombre des écailles sèches chez les variétés de l’oignon. L’analyse moléculaire de la diversité génétique des variétés de l’espèce Allium cepa sur la base de huit couples d’amorces SSR nous a permis de compter au total 48 fragments d’ADN amplifiés avec des démentions variant entre 90 et 296 pb pour les variétés d’oignon et 48 fragments d’ADN amplifiés avec des démentions variant entre 169 et 410 pb pour les variétés de l’ail .Le taux moyen de polymorphisme varie de 33% à 100 % chez les cultivars de l’oignon et de 75% à 100% pour les variétés d’ail ;Ce qui montre l’importante diversité génétique du patrimoine génétique de ces deux espèces. Les résultats de l’extraction ont révélé une légère variation de la teneur et des paramètres organoleptiques de l’huile essentielle dans les deux espèces étudiées. Cependant, l’étude phytochimique , la caractérisation physico chimique et l’analyse chimique des huiles essentielles testées ont confirmé une variation considérable entre les variétés de chaque espèce. La classification hiérarchique des génotypes d’oignon, selon les paramètres biochimiques se trouve controverser à celles qui sont s’effectuées selon, les paramètres moléculaire et l’analyse en coordonnée principale. Alors que, la séparation de ces accessions selon les paramètres morphologiques descriptifs des écailles sèches (adhérence après récolte, couleur de fond, intensité de la couleur et couleur de l’épiderme) montre que ces variables constituent les éléments les plus stables et les plus significatifs pour caractériser et distinguer entre les variétés de cette espèce. Par ailleurs, la structuration génétique des génotypes d’ail selon les paramètres physico-chimiques et organoleptiques ainsi que la composition chimique de l’huile essentielle montre que ces paramètres constituent les éléments les plus significatifs pour caractériser et distinguer entre les variétés de cette espèce. L'évaluation de l'effet antibactérienne montre que la plupart des souches bactériennes utilisées sont très sensible aux antibiotiques utilisés. Les HEs des variétés d’oignon : Rouge d'Amposta et Jaune d'Espagne ont exercé une faible activité antibactérienne à l'encontre de S. aureus, mais aucune activité antibactérienne à l'HE de Rouge locale n’a été observée. Les quatre variétés de l’ail sont révélées actives contre toutes les bactéries étudies à l’exception de la variété Messidrom qui n’a aucun effet avec toutes les bactéries sauf l’E.Coli. L'extrait brut de l’HE de la variété Rouge Locale et de la variété Mocpta Bulguar était les plus actifs parmi les autres extraits; ce qui est bien sûr expliqué par leur composition chimique.